Il s’est élevé contre la vaccination des enfants et a critiqué une politique de confinement excessive, ayant entraîné des dépenses exagérées. Pour lui, le vrai problème est l’hôpital dont les capacités ont été « excessivement » réduites « pour des raisons budgétaires ». Il propose donc un « plan de réinvestissement dans le système hospitalier » et « une organisation plus souple, fondée sur des pôles cliniques, avec de larges délégations de responsabilité ».
Côté médecine de ville, l’ordonnance est assez drastique : embauche de 1 000 médecins par l’État envoyés comme salariés dans les déserts médicaux, retour à l’obligation de garde pour les médecins, recours très encadré aux médecins étrangers.
Eric Zemmour s’est également prononcé contre la prolongation du recours à l’IVG, et contre l’assistance médicale à la procréation aux femmes seules ou en couple.